Genomová biologie - významné výstupy
Vědecké články, výstupy
Excelentní výsledky:
Záhonová K, Kostygov A, Ševčíková T, Yurchenko V, Eliáš M (2016) An unprecedented non-canonical nuclear genetic code with all three termination codons reassigned as sense codons. Current Biology 27:2364-2369. – objev nového typu genetického kódu publikovaný v jednom z nejprestižnějších biologických časopisů (IF = 8.983), všichni autoři jsou členové týmu na OU; má již 9 citací na WoS za méně než rok od vydání (září 2016).
Karnkowska A, Vacek V, Zubáčová Z, Treitli S, Petrželková R, Eme L, Novák L, Žárský V, Barlow LD, Herman EK, Soukal P, Hroudová M, Doležal P, Stairs CW, Roger AJ, Eliáš M, Dacks JB, Vlček Č, Hampl V (2016) A eukaryote without a mitochondrial organelle. Current Biology 26:1274-1284. – popis prvního eukaryotického organismu bez mitochondrie na základě analýzy jeho genomu, o významu svědčí již 26 citací na WoS za rok od vydání (květen 2016) a udělení Ceny Bedřicha Hrozného za tvůrčí počin na Univerzitě Karlově;
Derelle R, Torruella G, Klimeš V, Brinkmann H, Kim E, Vlček Č, Lang BF, Eliáš M (2015) Bacterial proteins pinpoint a single eukaryotic root. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 112:E693-E699. – Fylogenomikcá analýza upřesňující pozici kořene (nejhlubšího místa větvění) fylogeneze eukaryote, publikace v jednom z nejprestižnějších multioborových časopisů (IF = 9.674), již 29 citací na WoS, vybrána jako excelentní publikace v rámci II. pilíře hodnocení vědeckých institucí (2017);
Speijer D, Lukeš J, Eliáš M (2015) Sex is a ubiquitous, ancient, and inherent attribute of eukaryotic life. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 112:8827-8834. – publikace dokládající rozšíření pohlavního rozmnožování u eukaryot na základě analýzy genomů a transkriptomů a řešící jeho evoluční původ, publikace v jednom z nejprestižnějších multioborových časopisů (IF = 9.674), již 28 citací na WoS, vybrána jako excelentní publikace v rámci II. pilíře hodnocení vědeckých institucí (2017);
Curtis BA, Tanifuji G, Burki F, Gruber A, Irimia M, Maruyama S, Arias MC, Ball SG, Gile GH, Hirakawa Y, Hopkins JF, Kuo A, Rensing SA, Schmutz J, Symeonidi A, Elias M, Eveleigh RJ, Herman EK, Klute MJ, Nakayama T, Oborník M, Reyes-Prieto A, Armbrust EV, Aves SJ, Beiko RG, Coutinho P, Dacks JB, Durnford DG, Fast NM, Green BR, Grisdale CJ, Hempel F, Henrissat B, Höppner MP, Ishida K, Kim E, Kořený L, Kroth PG, Liu Y, Malik SB, Maier UG, McRose D, Mock T, Neilson JA, Onodera NT, Poole AM, Pritham EJ, Richards TA, Rocap G, Roy SW, Sarai C, Schaack S, Shirato S, Slamovits CH, Spencer DF, Suzuki S, Worden AZ, Zauner S, Barry K, Bell C, Bharti AK, Crow JA, Grimwood J, Kramer R, Lindquist E, Lucas S, Salamov A, McFadden GI, Lane CE, Keeling PJ, Gray MW, Grigoriev IV, Archibald JM (2012) Algal genomes reveal evolutionary mosaicism and fate of nucleomorphs. Nature 492:59-65. – příklad průlomové studie stojící na sekvenování a analýze genomů, publikace v mimořádně prestižním periodiku 138 citací na WoS za pět let od vydání, výsledek práce velkého mezinárodního týmu zahrnujícího
Články v časopisech (s IF či z databáze Scopus):
Pánek T, Žihala D, Sokol M, Derelle R, Klimeš V, Hradilová M, Zadrobílková E, Susko E, Roger AJ, Čepička I, Eliáš M (2017) Nuclear genetic codes with a different meaning of the UAG and the UAA codon. BMC Biology 15:8. [IF = 6.779]
Flegontov P, Changmai P, Zidkova A, Logacheva MD, Altınışık NE, Flegontova O, Gelfand MS, Gerasimov ES, Khrameeva EV, Konovalova OP, Neretina T, Nikolsky YV, Starostin G, Stepanova VV, Travinsky IV, Tříska M, Tříska P, Tatarinova TV (2016) Genomic study of the Ket: a Paleo-Eskimo-related ethnic group with significant ancient North Eurasian ancestry. Scientific Reports 6:20768. [IF = 4.259]
Kostygov A, Dobáková E, Grybchuk-Ieremenko A, Váhala D, Maslov DA, Votýpka J, Lukeš J, Yurchenko V (2016) Novel trypanosomatid-bacterium association: evolution of endosymbiosis in action. mBio 7:e01985-15. [IF = 6.956]
Flegontov P, Michálek J, Janouškovec J, Lai H, Jirků M, Hajdušková E, Tomčala A, Otto TD, Keeling PJ, Pain A, Oborník M, Lukeš J (2015) Divergent mitochondrial respiratory chains in phototrophic relatives of apicomplexan parasites. Molecular Biology and Evolution 32: 1115-1131. [IF = 6.202]
Kraeva N, Butenko A, Hlaváčová J, Kostygov A, Myšková J, Grybchuk D, Leštinová T, Votýpka J, Volf P, Opperdoes F, Flegontov P, Lukeš J, Yurchenko V (2015) Leptomonas seymouri: pre-adaptations to the dixenous life cycle analyzed by genome sequencing, transcriptome profiling and co-infection with Leishmania donovani. PLoS Pathogens 11:e1005127. [IF = 6.202]
Zveřejněno / aktualizováno: 17. 10. 2018
