Archiv výběrových řízení a nabídek zaměstnání

Specialista – bioinformatik se zaměření na software and web development

UPOZORNĚNÍ: Platnost tohoto inzerátu již vypršela.

Děkan Lékařské fakulty Ostravské univerzity vypisuje výběrové řízení k obsazení místa:

specialista - bioinformatik se zaměření na software and web development

Předpokládaný nástup:

říjen 2023 nebo dle dohody

Předpokládaný úvazek:

Kvalifikační a další předpoklady:

Mgr/PhD vzdělání zaměřené na bioinformatiku/informatiku
Velmi dobrá znalost anglického jazyka (komunikační úroveň zhruba na úrovni C1)
Praktická zkušenost s vývojem bioinformatických aplikací a pipeline (odkaz na Github/Gitlab repo pro software je výhodou)
Znalost Git a Github
Znalost Conda package manageru
Zkušenost s výzkumem biologického/biomedicínského zaměření
Znalost programovacích jazyků Bash, Python, R
Znalost workflow management jazyků Snakemake nebo Nextflow
Zkušenost s web developmentem a vytvářením webových aplikací
Zkušenost s prací na výpočetních cluster/superpočítačích
Znalost Docker a Singularity výhodou
Teoretické znalosti z molekulární biologie a hematologie výhodou
Velmi dobré organizační a komunikační schopnosti
Spolehlivost, pečlivost a schopnost týmové práce

Jazyk, ve kterém bude výběrové řízení vedeno:

anglický

Popis pracovního místa:

Bioinformatik/výzkumník by se měl zásadní mírou podílet na vytvoření Bioinformatického spin-offu zaměřeného na výuku, automatizovanou analýzu sekvenačních dat (DNA/RNA) a software development. Náplní práce bude mimo jiné i: příprava webu pro výše zmíněný spin-off, převedení již vytvořených pipeline ze Snakemake do Nextflow a následná "conteinarizace" virtuálních prostředí zajištující maximální reproducibilitu; vytváření nových pipeline; příprava bioinformatického softwaru, jeho maintanance a doprovodné publikace; provádění výpočetní analýzy sekvenačních data na výpočetních clusterech.

Přihlášky

Přihlášky, doklady o dosažené kvalifikaci, vyplněný souhlas se zpracováním osobních údajů a strukturovaný profesní životopis zasílejte do 13. září 2023 na níže uvedenou adresu personálního oddělení Lékařské fakulty Ostravské univerzity nebo na email: .

Vyhlašovatel si vyhrazuje právo na neobsazení pracovní pozice nebo zrušení výběrového řízení.

Pracovní pozice vznikla za finanční podpory Evropské unie v rámci projektu LERCO s reg. číslem CZ.10.03.01/00/22_003/0000003, prostřednictvím Operačního programu spravedlivá transformace.

logolink