Projekty a granty
Databáze všech projektů a grantů od roku 2010
Nadrodina Ras GTPáz a evoluce eukaryotické buňky | |
---|---|
Id projektu | GAP305/10/0205 |
Hlavní řešitel | prof. Mgr. Marek Eliáš, Ph.D. |
Období | 1/2011 - 12/2012 |
Poskytovatel | Standardní projekt GA ČR |
Stav | ukončený |
Anotace | Nadrodina Ras GTPáz zahrnuje ústřední složky mnoha významných drah v eukaryotické buňce a hraje roli ve vážných lidských chorobách, ale její celková sekvenční a strukturní diverzita a evoluce zůstávají v podstatě neprobádány. Tento projekt staví na současném pokroku v genomovém sekvenování a metodách bioinformatiky a fylogenetiky a má za cíl podrobnou evoluční a sekvenční analýzu nadrodiny Ras GTPáz u eukaryot. Pro analýzy využijeme sekvenční data z veřejných databází a z probíhajících genomových projektů pro jednobuněčná eukaryota Bigelowiella natans, Guillardia theta a Mastigamoeba balamuthi. Rozsáhlý taxonomicky bohatý datový soubor podrobíme detailní analýze sekvencí a proteinových struktur. Podrobnou fylogenetickou analýzou vymezíme evolučnívztahy v rámci nadrodiny a její zrekonstruovanou evoluční historii porovnáme s hlavními událostmi v evoluci eukaryot a eukaryotické buňky. |